Kurs podatku VAT oraz podatków dochodowych w podmiotach medycznych 2026

Temat 1 – Podatek VAT w podmiotach medycznych (2 dni) – stare problemy nowe interpretacje.

1. Krajowy System e-Faktur (KSeF) i jego zastosowanie w podmiocie medycznym.

• Cel wprowadzenia i założenia.
• Faktura ustrukturyzowana a faktura elektroniczna.

• Wystawienie, otrzymanie i przesłanie faktury ustrukturyzowanej.

• Wysyłka faktur do KSeF – wykorzystanie programów finansowo – księgowych (API).
• Data wystawienia, data przesłania i data otrzymania faktury ustrukturyzowanej – konsekwencje prawne i podatkowe stosowania nowej regulacji.
• Funkcjonalności KSeF.
• Wyznaczenie obligatoryjnego zakresu zastosowania.
• Podział bazy klientów.
• Zwolnienia z obowiązku stosowania faktury ustrukturyzowanej.
• Przypadki udostępniania faktury poza KSeF.
• Zasady pierwszego uwierzytelnienia się w systemie – uprawnienia właścicielskie.
• Nadawanie uprawnień do wysyłki i odbioru faktur (token, ceryfikat autoryzujący).
• Konto podatnika – możliwość tworzenia subkont dla członków grup VAT i jednostek samorządu terytorialnego (IdWew/GLN).
• Funkcje pracowników w procesie stosowania KSeF.
• MCU – Moduł Certyfikatów i Uprawnień.
• Faktura offline24.
• Faktura dla osoby fizycznej.
• Faktura korygująca ustrukturyzowana.
• Sankcje podatkowe za nieprawidłowe wystawienie faktury.
• Struktura logiczna JPK-FA(3).
• Wizualizacja faktury – kiedy obowiązek oznaczenia faktury kodem QR.
• Korekty i rozliczenie korekt wynikających w faktur ustrukturyzowanych (zasady korekty podatku należnego i naliczonego – usunięcie not korygujących).
• Awarie i niedostępność KSeF a fakturowanie i dodatkowe obowiązki.
• Sankcje związane z nieprawidłowościami w stosowaniu KSeF.

1. Omówienie aktualnych schematów JPK w zakresie zgodności oznaczeń JPK z KSeF, symbole GTU i procedur z JPK na fakturach wystawianych przez podmiot medyczny.
   • Podstawa opodatkowania i podatek należny od poszczególnych rodzajów transakcji.
   • Dodatkowe kody/oznaczenia identyfikujące poszczególne dostawy i usługi (GTU – klasyfikacja z punktu widzenia sprzedawanych towarów i usług).
   • Dodatkowe kody/oznaczenia identyfikujące powiązania pomiędzy podatnikiem, a kontrahentami innymi niż jednostki budżetowe.
   • Faktura do paragonu (ujęcie w ewidencji VAT) oraz faktura uproszczona w nowym JPK_VAT.
   • Oznaczenia dowodów sprzedaży – kiedy podatnik ma je zastosować?
     • Dokument wewnętrzny.
     • Faktura do paragonu.
     • Dokument z kasy fiskalnej.
   • Dodatkowe oznaczenia/kody dowodów nabycia u podatnika.
2. Symbole PKWiU i kody CN oraz ich zastosowanie na fakturach wystawianych przez podmiot medyczny.
3. Faktury objęte mechanizmem podzielonej płatności.
4. Obowiązek podatkowy i podstawa opodatkowania przez podmiot medyczny – wybrane zagadnienia.
   • Usługi opieki medycznej.
   • Obligatoryjna metoda kasowa w służbie zdrowia – m.in. kserokopie dokumentacji medycznej dla Sądów.
   • Badania kliniczne – omówienie wyroku TSUE C-191/12 – zmiana linii orzeczniczej NSA
   • Usługi najmu i refaktura mediów.
   • Podstawa opodatkowania i jej korekty.
   • Świadczenia kompleksowe jednostki medycznej, a VAT.
   • Stawki VAT w działalności jednostki medycznej – nie zawsze zwolnienie.
5. Pozostałe kwestie dotyczące rozliczenia podatku VAT przez podmiot medyczny.
   • Odliczenie podatku naliczonego przez podmiot medyczny.
   • Odliczenie według struktury sprzedaży oraz korekty (sygnalizacja tzw. prewskaźnika).
   • Transakcje międzynarodowe (np. WNT, import i eksport usług, kwestia Brexitu) przez podmiot medyczny – wybrane problemy.
   • Zasady przeliczania kwot wyrażonych w walucie obcej.
   • Zakup produktów rolnych od rolnika ryczałtowego i faktura VAT RR.
   • Czynności nieodpłatne przez podmiot medyczny.
   • Zwolnienie podmiotowe przez podmiot medyczny – wskazanie takiej możliwości dla mniejszych placówek.
   • Biała lista i KUP.
   • Pre-współczynnik i współczynnik VAT w szpitalach.

Temat 2 – Podatek dochodowy w podmiotach medycznych (CIT, PIT – obowiązki Płatnika)  (2 dni).

1. Podmiot medyczny jako podatnik podatku dochodowego od osób prawnych.
   • Zakres stosowania zwolnienia podmiotowego z CIT.
   • Zakres stosowania zwolnienia podmiotowo-przedmiotowego z CIT (wydatki na cele statutowe i niestatutowe).
2. Przychody podmiotu medycznego i zasady ich ustalania.
   • Przychody należne w działalności medycznej w kontekście rozliczeń z NFZ (kontraktowe i ponadkontraktowe) – w tym ustalanie momentu powstania przychodu w przypadku przesunięcia rozliczeń w ramach limitu oraz nadwykonań.
   • Przychody należne z tytułu wykonania usług medycznych na zasadach komercyjnych.
   • Refaktura, a przychód.
   • Moment wykonania usługi.
     • Usługi wykonywane przez podmioty współpracujące – lekarzy, pielęgniarki, konsultantów, wolontariuszy itp.
     • Badania kliniczne, analizy, diagnostyka – przegląd interpretacji.
     • Rehabilitacja.
     • Ekspertyzy dla sądów i prokuratur.
     • Usługi szkoleniowe, (w tym współpraca z uczelniami w zakresie kształcenia).
     • Usługi reklamowe.
     • Usługi najmu oraz dzierżawy.
     • Usługi hotelowe i gastronomiczne.
   • Zasady rozliczania:
     • przychodów w naturze,
     • przychodów z tytułu nieodpłatnych świadczeń i świadczeń częściowo odpłatnych.
   • Zasady dokonywania korekty przychodów – w tym m.in. z tytułu:
     • błędów w wystawionych fakturach,
     • kwestionowania przez NFZ rozliczeń wykazanych przez podmiot medyczny świadczeń medycznych.

1. Koszty w działalności leczniczej.
   • Koszty uzyskania przychodów.
     • Kwalifikacja ogólna.
     • Celowość / dokumentowanie.
   • Podział na koszty bezpośrednie i pośrednie w działalności leczniczej.
   • Zasady potrącalności kosztów w czasie – koszty „bezpośrednie” i „pośrednie”.
   • Koszty rozliczane metodą kasową.
   • Jak określić, które z wydatków są, a które nie są powiązane z celami statutowymi?
   • Koszty podmiotów przekształcanych u następców prawnych.
   • Wydatkowanie środków na działalność statutową, a przekształcenie.
   • Korekta roczna podatku VAT w kosztach uzyskania przychodu.
   • Zasady ujmowania wierzytelności nieściągalnych w kosztach podatkowych.
   • Zasady dokumentowania kosztów.
   • Zasady korygowania kosztów w działalności leczniczej.
     • Termin uregulowania zapłaty za faktury dokumentujące wydatki zaliczane do kosztów bezpośrednich oraz pośrednich.
     • „Wyjście” towaru z magazynu, a brak zapłaty – konsekwencje w zakresie korekty kosztów.
     • Kontrowersje związane z momentem ujęcia korekty kosztów w rozliczeniach podatkowych podmiotu leczniczego – korekta „na bieżąco”, czy „wstecznie”?
     • Rozłożenie płatności na raty przez dostawcę, a konieczność korekty kosztów.
     • Regulowanie należności w kolejnych okresach rozliczeniowych skutkujące „kasowym” ujęciem kosztów – korzyści dla podmiotu leczniczego.
     • Brak zapłaty za faktury z tytułu nabycia bądź wytworzenia środka trwałego albo wartości niematerialnych i prawnych – obowiązkowa korekta w odniesieniu do amortyzacji.

1. Amortyzacja podatkowa składników majątku w podmiocie medycznym.
   • Kryteria zaliczenia składnika majątku do środków trwałych oraz wartości niematerialnych i prawnych.
   • Środki trwałe oraz wartości niematerialne i prawne nie podlegające amortyzacji podatkowej.
   • Zasady określania wartości początkowej – w tym m.in. otrzymanie przez podmiot medyczny sprzętu medycznego.
   • Ulepszenie środka trwałego – wpływ na wartość początkową oraz odpisy amortyzacyjne.
   • Przyłączenie oraz odłączenie części składowych i części peryferyjnych – wpływ na wysokość odpisów amortyzacyjnych.
   • Metody oraz stawki amortyzacji.
   • Straty w środkach trwałych oraz likwidacja środka trwałego, w tym inwestycji w obcym środku trwałym.
   • Zaniechane inwestycje.
   • Leasing środków trwałych oraz wartości niematerialnych i prawnych.
   • Środki trwałe sfinansowane z dotacji UE – zasady ich rozliczania przez podmiot leczniczy.
2. Zasady sporządzania deklaracji podatkowych CIT-8 przez podmioty medyczne.
   • Znaczenie przychodów i kosztów bilansowych.
   • Przychody zwolnione z opodatkowania.
   • Przychody niepodlegające opodatkowaniu.
   • Przychody podlegające opodatkowaniu w roku bieżącym, ujęte w księgach rachunkowych lat ubiegłych.
   • Dochody wolne od podatku.
   • Koszty niestanowiące kosztów uzyskania przychodu.
   • Koszty lat ubiegłych.
   • Korekty przychodów i kosztów.
   • Kalkulacja podatku.
3. Podatek u źródła (WHT).
   • Konstrukcja opodatkowania – zasady poboru podatku przez płatnika.
   • Należyta staranność/certyfikat rezydencji – warunki stosowania umów o unikaniu podwójnego opodatkowania.
   • Przegląd świadczeń występujących w podmiotach medycznych podlegających opodatkowaniu podatkiem u źródła.
   • Zakup licencji na oprogramowanie do sprzętu medycznego.
   • Serwis sprzętu wykonywany przez podmioty zagraniczne.
4. Koszty pracownicze/obowiązki płatnika.
   • Moment ujęcia kosztów pracowniczych i składek ZUS od 2023 r.
   • Przegląd wybranych kosztów pracowniczych – świadczenia pozapłacowe.
   • Zasady poboru zaliczki od 01.01.2023 r. – oświadczenia i wnioski mające wpływ na obliczenie zaliczki.
5. Zagadnienia wybrane
   • Podatek minimalny – wyłączenia dla spółek medycznych.
   • Ulga na złe długi.
   • Płatności bezgotówkowe/split payment/biała lista.
   • Raportowanie schematów podatkowych w podmiotach z branży medycznej.
   • Obowiązki sprawozdawcze i informacyjne w podmiotach medycznych.
   • Przesyłanie ksiąg i ewidencji w zakresie CIT – JPK_KR.
   • Struktura JPK_KR-PD (jakie informacje obowiązkowo za okres od 1.01.2025 a jakie za okres od 1.01.2026).

• Kurs w trybie: online
• Czas trwania: 28 godz. dydaktyczne, tj. 4 spotkań po 7 godzin dydaktycznych, w godz. 9.00 – 15.00.
• Nagrania wideo – nagranie każdego szkolenia jest dostępne do 21 dni od daty jego realizacji (nagrania są wysyłane do 3 dni roboczych od daty realizacji szkolenia)

• Termin ustalimy: po dodaniu do koszyka, ustalimy z Tobą możliwe terminy realizacji.
• Darmowe konsultacje: konsultacje z ekspertem są dostępne do 7 dni roboczych od daty zrealizowanego szkolenia (konsultacje odbędą się za naszym pośrednictwem oraz powinny dotyczyć zakresu zrealizowanego szkolenia)

• Materiały szkoleniowe w formie pdf: materiały w formie pdf zostaną do Ciebie podesłane dzień roboczy przed szkoleniem.
• Link dostępowy do szkolenia (z platformy Clickmeeting): link zostanie do Ciebie podesłany dzień roboczy przed szkoleniem do godz. 14.00